Por Eric Batista, Leonardo Cordeiro e Vitor Fonseca
A Computação de Alto Desempenho é uma área da Ciência da Computação cujo objetivo é estudar o desenvolvimento e uso de supercomputadores, máquinas que sejam capazes de processar grandes volumes de dados, em uma velocidade rápida e de maneira eficaz, permitindo que problemas complexos sejam resolvidos de maneira mais fácil. Esta área possibilitou muitos avanços em diversas áreas, tanto em estudos a respeito de química e física, como a interação entre partículas, até aplicações na área de biologia, como simulações que permitiram melhor compreensão a respeito do funcionamento de proteínas.
No início de 2020, surgiu uma crise global no campo da saúde em razão da pandemia do Covid-19, causada pelo vírus Sars-CoV-2. Com isso, diversas equipes estão trabalhando dia e noite, tentando encontrar formas de compreender e estudar a doença, com o propósito de encontrar possíveis tratamentos e curas. Portanto, o objetivo desta matéria é listar alguns projetos que estão usando técnicas de Computação de Alto Desempenho para combater a pandemia.
Devido à gravidade da doença e sua rápida propagação, a corrida em busca da cura é o principal foco para a maioria dos países. Nos Estados Unidos, por exemplo, a Casa Branca uniu-se com diversas empresas que disponibilizam a Computação de Alto Desempenho, como Amazon, Google, IBM e até o Instituto de Tecnologia de Massachusetts (MIT), para formar o Covid-19 High Performance Computing Consortium, que permitirá que pesquisadores e pessoas com ideias para combater a doença tenham as ferramentas disponíveis para alcançar um objetivo mundial.
A empresa Folding@Home, além de utilizar serviços de Alto Desempenho, permite que qualquer computador, através de um software disponibilizado por eles, se conecte a uma rede de computadores para auxiliar o processamento, enquanto o usuário deste computador segue fazendo suas atividades diárias. O foco desta empresa é analisar as proteínas, cadeias de aminoácidos e átomos de doenças, pois estas estruturas se movimentam e a captura deste movimento é bem difícil. Com essas simulações é possível encontrar pontos fracos nessas estruturas, onde medicamentos podem fazer efeitos. No último artigo publicado pela empresa, foi identificado uma vulnerabilidade na estrutura do Ebola, que será explorada por medicamentos que estão sendo testados para combater a doença. O objetivo agora é fazer o mesmo processo com o Covid-19, para que os testes de medicamentos sejam mais eficazes.
No Brasil, existe o projeto “Supercomputação na luta contra o coronavírus” promovido pelas instituições SENAI CIMATEC, NVIDIA e Atos. Esta iniciativa busca fornecer para pesquisadores e Startups ferramentas para acelerar a realização de testes e simulações que levariam anos para serem feitos usando computação tradicional. Tudo com uma ferramenta de suporte para auxiliar aqueles que nunca tiveram contato com essa tecnologia antes. Para ter acesso, basta preencher informações sobre a instituição, a pesquisa e o pesquisador, para que os responsáveis do projeto entrem em contato com o interessado.
Referências
Edson Borin. Introdução à Computação de Alto Desempenho na Nuvem Computacional. Sol.sbc (2018). Disponível em: <https://sol.sbc.org.br/livros/index.php/sbc/catalog/download/25/91/187-1?inline=1>, acesso em 27 abr. 2020
Época Negócios. IBM vai usar supercomputadores para pesquisar cura para coronavírus, em parceria com governo dos EUA. Época Negócios (24/03/2020). Disponível em: <https://epocanegocios.globo.com/Tecnologia/noticia/2020/03/ibm-vai-usar-supercomputadores-para-pesquisar-cura-para-coronavirus-em-parceria-com-governo-dos-eua.html>, acesso em: 27 abr. 2020
DINO. Northern Data: Pandemia do Corona/COVID-19 leva a aumento maciço na demanda por capacidade de computação. Terra (30/03/2020). Disponível em: <https://www.terra.com.br/noticias/dino/northern-data-pandemia-do-coronacovid-19-leva-a-aumento-macico-na-demanda-por-capacidade-de-computacao,23c459937db7b0571eff480aabd77784uitse05t.html>, acesso em 27 abr 2020
EFE, e Washington. EUA criam consórcio para uso de supercomputadores no combate a coronavírus. Uol (24/03/2020). Disponível em: <https://economia.uol.com.br/noticias/efe/2020/03/24/eua-criam-consorcio-para-uso-de-supercomputadores-no-combate-a-coronavirus.htm>, acesso em 27 abr 2020
Projeto Super computação na luta contra o Coronavírus Disponível em: <https://hpc2covid19.fieb.org.br/>, acesso em 27 abr 2020
John Chodera. FOLDING@HOME UPDATE ON SARS-COV-2 (10 MAR 2020). Foldingathome (10/03/2020). Disponível em: <https://foldingathome.org/covid19/>, acesso em 27 abr 2020
Fonte da imagem: Shutterstock